Na sequência do Protocolo de Cooperação assinado, a 21.10.2003 entre a Santa Casa da Misericórdia de Lisboa e a Direção-Geral dos Edifícios e Monumentos Nacionais (extinta em 2007), as duas instituições desenvolveram um projeto conjunto de informação e inventariação do património arquitetónico da SCML. Para tal, utilizaram a metodologia do Sistema de Informação para o Património Arquitetónico-SIPA, cuja responsabilidade de gestão cabe, desde 2007, ao  Instituto da Habitação e  Reabilitação Urbana (IRHU). Os links aqui apresentados, permitem a consulta das fichas de inventário de imóveis da SCML que constam do SIPA, disponíveis no site  www.monumentos.pt: 

• Igreja e Casa Professa de São Roque
• Convento de São Pedro de Alcântara
• Palácio dos Marqueses das Minas
• Centro Social de São Boaventura
• Quinta Alegre / Quinta do Marquês do Alegrete
• Palácio Monte-Real /Centro Social da Sé
• Residência Faria Mantero
• Aldeia de Santa Isabel
• Prédio com fachada de azulejos Arte Nova na Av. Almirante Reis, N.º 74
• Prédio na Tv. Condessa do Rio
• Creche Victor Manuel / Centro de Acolhimento Infantil Victor Manuel / Unidade Local de Saúde da Tapada
• Vivenda Quadros / Internato Infantil de Carcavelos / Lar de S. Francisco de Assis
• Centro de Saúde e Serviço Social Dr. José Domingos Barreiro / Centro de Acolhimento Infantil Dr. José Domingos Barreiro
• Prédio na Rua da Rosa nº 277, r/c
• Prédio na Avenida Almirante Reis, nº 60 / Lar de Nossa Senhora do Anjos
• Creche do Alto do Pina / Casa dos Plátanos
• Prédio Pombalino de gaveto entre a Rua dos Douradores n.º 96-104 e a Rua da Vitória, nº 10-16
• Prédio Pombalino de gaveto entre a Rua da Prata, n.º 156 e a Rua da Vitória, nº 26 - 30
• Prédio Pombalino na Rua da Madalena n.º 198 a 202
• Prédio Pombalino na Rua dos Sapateiros, n.º 129 a 133
• Edifício na Avenida D. Carlos I, nº 126
• Refeitório dos Anjos / Cozinha Económica dos Anjos
• Hospital Ortopédico de Sant'Ana
• Escola Froebel, Creche da Estrela